Laboratorul de histopatologie are în structura sa un compartiment de histopatologie, citologie şi un compartiment de imunohistochimie.

Compartimentul de histopatologie: este prevăzut cu încăperi destinate prelucrării probelor şi respectiv încăperi destinate examinării materialelor. În incinta Laboratorului se găseşte şi un spaţiu destinat depozitării materialelor. 

Compartimentul de citologie: este o încăpere cu o suprafaţă de 20 mp destinată examinării frotiurilor.
Coloraţia frotiurilor şi depozitarea acestora se face într-o încăpere comună cu compartimentul de histopatologie.
Compartimentul de imunohistochimie: o încăpere separată cu posibilităţi de păstrare a anticorpilor folosiţi.
Laboratorul mai are în structura sa o sală de aşteptare, un secretariat unde se face arhivarea şi eliberarea rezultatelor şi spaţii anexe.  

Compartimentul de prosectură: este prevăzut cu o sală de autopsie, sala de aşteptare pentru aparţinători, sală agregat frigorific având acces separat pentru cadavre şi personal.

Serviciile laboratorului:

– examinări histologice şi imunohistochimice;
– examinări citologice;
– autopsia cadavrelor;

Personalul laboratorului participă şi la activitatea didactică a Şcolii Sanitare Postliceale ce funcţionează în cadrul Spitalului Municipal Odorheiu Secuiesc.